Contexte
Cette étude est proposée dans le cadre d'une collaboration entre des cardiologues du CHU Henri Mondor de Créteil et des chercheurs en analyse d'images à l'ESIEE dont l'objectif est de mieux comprendre, et ainsi mieux pronostiquer, la guérison de patients ayant subi un infarctus du myocarde.
Problématique
Dans cette optique l'Imagerie par Résonance Magnétique (IRM) fournit de précieuses informations à travers des séquence d'images 2D et 3D du coeur (voir par exemple la figure ci-dessous).
Pour pouvoir analyser (visuellement ou par ordinateur) et/ou comparer entre elles de telles images, il est souhaitable que les pixels de plusieurs images différentes appartenant à un même tissu ou organe aient des intensités lumineuses identiques. Par exemple, il serait souhaitable que les zones dans les images 1 et 2 (ci-dessus) correspondant aux cavités sanguines soient de même intensité : par exemple 255, c'est-à-dire blanc. Malheureusement, comme on peut le voir sur l'exemple, les appareils d'acquisitions d'IRM n'offrent pas cette garantie. On dit que les images du coeur produites par IRM ne sont pas standardisées. Afin de résoudre ce problème, c'est le plus souvent le médecin qui agit manuellement sur un paramètre d'affichage afin d'harmoniser les contrastes (voir, par exmple les images ci-dessous).
Objectif
L'objectif du projet est d'étudier, programmer et tester une méthode de standardisation automatique d' IRM cardiaques. Pour cela, vous implémenterez la méthode proposée dans l'article [1] pour les IRM cérébrales, vous la testerez sur des images cardiaques et, si nécessaire, proposerez des adaptations spécifiques à ce type d'images.
Programmation
Le projet sera réalisé dans le langage de votre choix, cependant le C (ou C++) est conseillé. Vous pourrez vous appuyer sur la bibliothèque de traitement d'images Pink développée à l'ESIEE (en langage C) et sur la bibliothèque GDCM développée au laboratoire CREATIS de Lyon.
Référence
[1] L. G. Nyul, J. K. Udupa, and X. Zhang, New variants of a method of MRI Scale Standardization, IEEE Trans. on Medical Imaging, vol 19, no 2, 2000. [copies papier disponibles en 5307]